сайты, откуда можно взять первичные последовательности белков

Mice31

срочно нужно найти такой, чтобы скачать последовательности для каинатных рецепторов
может, кто в этом разбирается ?
а еще есть сайт, там где данные трехмерных структрур для тех же белков, только я его тоже не помню. там какая-то аббревиатура.

sidorskys

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Там есть и поиск (Protein - среди последовательностей белков, по словам и ссылки на все основные базы данных.
Как найдёшь нужные, можно их в желаемом формате скачать.
Есть там также и системы по поиску гомологичных белков (BLAST, FASTA).
 Ещё тут список есть.
Трёхмерные, не считая нижеупомянутого pdb.org, можно найти, выбрав поиск по Structure. Насколько я понимаю, там ведётся поиск в наборе protein data bank.
Можно сразу по всем базам искать (All databases тогла выедется список поисковых направлений и в скобках, сколько вхождений найдено. Далее можно необходимое открыть и посмотреть подробнее.

bazuka1

www.pubmed.org в разделе proteins - последовательности
и www.pdb.org - protein data bank - структуры,
можешь еще заглянуть на сайт http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/ - найдешь и последовательности и доменную организацию белков

Mice31

pdb.org - то, что надо =)
спасибо, ребят!
а вы этим занимались ?

bazuka1

В смысле занимались? Проходили на семинарах

Mice31

ну, мб моделированием занимались, я думал.
Оставить комментарий
Имя или ник:
Комментарий: