Трехмерные структуры белков

kjjff

Народ, подскажите, где можно достать картинки трехмерных структур белков.
Желательно, чтобы можно было еще выбрать сиквенс отдельных полипептидных цепей (желательно, но нужно).
Чтобы видеть, какие аминокислоты снаружи, какие внутри и т.д.
Кто занимается белками?
Меня интересуют четыре белка.

kjjff

я еще в инете находил какие-то ссылки на конкретный белок, только вот структура не грузилась...
может для этого какой-то софт нужен?

Nitochka

Нужен, но какой именно не помню. Вроде как на сайте ХПС было упоминание.

sidorskys

Программы визуализации?
Можно, например, в . Простая, но удобная. А так очень много разных программ есть.
Там можно разные части белка представить в разном виде и разными цветами.
Можешь ещё попробовать , но там много лишней для этих целей функциональности.
Можно ещё испольовть утилитку 3d molecule viewer из программы VNTIAdvance. Там удобно то, что можно одновременно видеть амк-последовательность, выделять в ней мышкой участки. А в остальном почти как RasMol.

Только сначала нужно загрузить саму структуру из какой-нибудь базы данных. На сайте NCBI , например, можно по названию найти и загрузить.

FANTOM

Попробуй это

Bluff

спроси у Антона ( он же этим как раз занимается
Оставить комментарий
Имя или ник:
Комментарий: